Le Haut-Rhin présente un profil particulier dans la progression du frelon asiatique en France. Ce département, fusionné avec le Bas-Rhin dans la Collectivité européenne d'Alsace (CEA) depuis 2021, couvre la partie méridionale de l'Alsace, de Colmar à la frontière suisse. La plaine alsacienne, encadrée à l'ouest par les Vosges et à l'est par le Rhin, bénéficie d'un des microclimats les plus chauds et ensoleillés de France, avec des étés particulièrement propices au développement des colonies. Colmar, préfecture et capitale alsacienne de la vigne, et Mulhouse, principal pôle industriel et urbain, concentrent les signalements les plus nombreux.
La plaine viticole entre Guebwiller, Rouffach et Colmar est au cœur de la problématique. Les milliers d'hectares de vignes grand cru alsacien, ponctués de caves viticoles, d'anciennes fermes et de haies bocagères, offrent un terrain d'installation idéal. Le frelon asiatique, prédateur des abeilles pollinisatrices, constitue une menace directe pour l'apiculture et la viticulture dans ce secteur. Les communes de Wintzenheim, Wettolsheim, Ammerschwihr et Kaysersberg-Vignoble signalent des nids chaque année, souvent découverts tardivement dans les pommiers ou sous les toits de caves.
L'agglomération mulhousienne, avec ses quartiers résidentiels denses et ses nombreux espaces verts, est un foyer de signalement majeur. Mulhouse et ses communes voisines comme Illzach, Wittenheim, Kingersheim, Rixheim et Habsheim présentent une concentration importante de jardins arborés et de pavillons avec haies favorisant la nidification. Le Sundgau, territoire rural vallonné au sud du département, entre Altkirch et la frontière suisse, voit également une progression notable, avec des nids régulièrement découverts dans les fermes et les bois privés.
La vallée de la Thur, entre Thann, Cernay et Vieux-Thann, et la vallée de la Doller constituent des axes de progression naturels depuis la plaine vers les collines sous-vosgiennes. Les communes de ces vallées, avec leurs jardins orientés plein sud et leurs vergers, profitent d'un microclimat encore plus favorable. Saint-Louis et l'agglomération frontalière autour de Bâle présentent un profil spécifique : forte densité résidentielle, espaces verts partagés et corridors transfrontaliers qui facilitent la diffusion de l'espèce entre France, Allemagne et Suisse.
Les zones humides rhénanes jouent également un rôle dans la dynamique de l'espèce. Le long du Rhin, de Rosenau à Kembs et jusqu'à Chalampé, les bandes de forêts alluviales et les anciens méandres constituent des zones de refuge et de dispersion. La FDGDON 68 et la Chambre d'agriculture travaillent en partenariat pour coordonner les signalements et les destructions, en particulier dans les secteurs viticoles et apicoles. Les apiculteurs du Haut-Rhin, réputés pour la production de miel d'acacia et de forêt vosgienne, subissent une pression croissante sur leurs ruchers.